Fazendo este procedimento, a sua conta do Facebook será desativada, mas não será excluída.
Isso significa, portanto, que, caso um dia você mude de idéia e decida retornar ao Facebook, bastará reativar a sua conta a qualquer momento utilizando o mesmo login, não sendo necessário criar um novo cadastro a partir do zero.
Lembre-se que, mesmo com a sua conta não sendo excluída, você não poderá trocar recados com outros perfis do site ou realizar qualquer outra ação restrita a usuários enquanto sua conta estiver desativada.